Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZA3Q96KX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms