Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED3Q96IU2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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