Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA7LQ96GN5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDCA7LQ96GN5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDCA7LQ96GN5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms