Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms