Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms