Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3DQ96BQ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms