Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKL1Q969V6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKL1Q969V6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms