Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRAT1Q92837 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms