Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOPBP1Q92547 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOPBP1Q92547 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms