Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113Q902F9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERVK_113Q902F9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms