Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms