Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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