Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC4Q8NCT1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC4Q8NCT1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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