Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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