Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms