Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms