Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC4Q8N9L1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms