Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC83Q8IWF9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC83Q8IWF9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms