Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms