Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3FQ8IUX4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3FQ8IUX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms