Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX7Q7RTT5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms