Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms