Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR3Q6ZT12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR3Q6ZT12 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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