Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms