Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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