Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTR9Q6PD62 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms