Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFCAB12Q6NXP0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms