Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NANOGP8Q6NSW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms