Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD40Q6AI12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms