Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms