Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms