Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM78Q5T7P6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM78Q5T7P6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms