Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1TD1Q5T7N2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms