Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CEP170Q5SW79 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms