Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC39AQ5SRH9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms