Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COLEC12Q5KU26 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms