Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms