Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms