Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP100Q494V2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP100Q494V2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms