Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms