Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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RTL8BQ17RB0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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