Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN1Q16799 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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