Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms