Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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