Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNXAQ16473 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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