Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SSX1Q16384 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SSX1Q16384 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX1Q16384 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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