Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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