Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CST6Q15828 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CST6Q15828 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CST6Q15828 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CST6Q15828 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CST6Q15828 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CST6Q15828 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CST6Q15828 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CST6Q15828 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CST6Q15828 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CST6Q15828 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms