Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNA2Q15822 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA2Q15822 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms