Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SF1Q15637 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SF1Q15637 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SF1Q15637 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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